Процесс когнитивного моделирования представить в виде следующей последовательности этапов.

1. Определение цели.
2. Построение нечеткой когнитивной карты.
2.1. Определение списка концептов, значимых для данной предметной области. Для каждого концепта необходимо определить уровневую шкалу, на которой будут задаваться значения концепта.
2.2. Определение отношений причинности (влияния) между каждой парой концептов.
2.3. Определение знака влияния (положительное или отрицательное) между каждой парой концептов, связанных отношением причинности.
2.4. Определение силы влияния между каждой парой концептов, связанных отношением причинности.
2.5. Определение начального состояния концептов.
2.6. Определение внешних влияний на концепты.
В случае группового экспертного опроса, каждый из этапов 2.1-2.6 должен завершаться согласованием полученных результатов.
3. Статическое моделирование, в рамках которого производится вычисление и анализ системных показателей нечеткой когнитивной карты. На основе полученных данных выполняется генерация базового множества альтернатив.
4. Динамическое моделирование, выполняемое при помощи математического аппарата импульсных процессов. Его результаты позволяют получить сценарий развития ситуации для каждой альтернативы с учетом внешних влияний.
5. Отбор альтернатив на основе полученных сценариев развития ситуации и заданной цели. Полученное множество альтернатив передается ЛПР для дальнейшего анализа и обработки.